主持所全面工作。主管人才工作、國內外合作交流工作。分管所長辦公室。聯系觀賞植物研究中心、植物生態與環境研究中心。
主持所黨委全面工作。主管組織工作、安全和保密工作、財務工作、法務及規章制度建設工作。分管黨委辦公室、離退辦、財務處（招標辦）。聯系草業研究中心、果樹研究中心。
主持所紀委、省監委派駐所監察專員辦公室全面工作。分管紀委辦公室（審計處）、監督檢查處（審查調查處）。
主管規劃建設工作，后勤工作，研究生教育工作。分管建設管理和后勤保衛處、園藝和科普教育中心、植物遷地保護中心。聯系藥用植物研究中心。
