近日,所(園)在傘形科變豆菜屬植物系統發育關系中取得重要進展。相關研究成果以 “Complete chloroplast of four Sanicula taxa (Apiaceae) endemic to China: lights into genome structure, comparative analysis and phylogenetic relationships”為題發表于國際著名植物學雜志BMC Plant Biology(中科院2區,IF=5.3)。
變豆菜屬(Sanicula)全世界約45種,廣泛分布于東亞至北美,是傘形科(Apiaceae)中一個分類困難且具有較高藥用價值的屬。由于主要形態特征的多樣性,該屬的分類學與系統學長期以來一直存在爭議。我國是變豆菜屬最重要的分布中心之一,約有18種2變種。目前,葉綠體基因組通常被認為是保守的,在進化關系研究中發揮著重要作用。為了研究中國變豆菜屬的質體進化和系統發育關系,本研究綜合分析了13個中國變豆菜屬植物葉綠體的結構特征,并重建了它們的系統發育關系。結果可以為該屬的系統發育和進化研究提供重要的數據,并為今后該屬藥用種質資源的研究提供參考。
植物分類項目組李慧敏博士為該論文第一作者,宋春鳳副研究員為通訊作者。該研究成果得到了江蘇省自然科學基金(BK20200294),國家自然科學基金面上項目(32370220),以及所開放基金(JSPKLB201923)的資助。
論文鏈接:https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-023-04447-w
圖1 四個首次報道的變豆菜屬植物葉綠體基因組圖譜
圖2 15個葉綠體基因組的SC/IR連接的比較
圖3 基于13個Sanicula樣本,使用79個串聯的PCG基因,通過ML、MP和BI分析得到系統發育樹